Was ist das XYZ-Dateiformat?
.xyz ist ein reines Textdateiformat, das von verschiedenen Chemieprogrammen unterstützt wird. .xyz-Dateien speichern Moleküldaten als Klartext: die Anzahl der Atome (Zeile 1), einen frei wählbaren Kommentar (Zeile 2) und eine Zeile pro Atom mit einem Elementsymbol sowie X-, Y- und Z-Koordinaten in Angström. Obwohl .xyz keine formale Spezifikation hat, ist es weit verbreitet - ein De-facto-Gemeinschaftsstandard, der Anfang der 1990er Jahre mit dem Programm XMol entstand.
Das Format speichert nur Elementsymbole und Koordinaten; es enthält standardmäßig keine Bindungsordnungen, Partialladungen oder Elementarzellendaten. Eine beliebte Erweiterung namens Extended XYZ (extxyz) fügt key=value-Metadaten in der Kommentarzeile hinzu. Mehrere Blöcke können in einer Datei hintereinandergefügt werden, um eine Trajektorie zu speichern. Der MIME-Typ ist chemical/x-xyz.
Die Dateiendung .xyz wird nicht ausschließlich von Chemieprogrammen verwendet. Es ist nicht ungewöhnlich, Textdateien jeglicher Art mit einem .xyz-Suffix zu finden. Bevor Sie mit .xyz-Dateien arbeiten, empfiehlt es sich, unter Windows die Option „Erweiterungen bei bekannten Dateitypen ausblenden“ zu deaktivieren, um Probleme bei der Dateiidentifikation zu vermeiden. Verwandte Formate sind .mol, .pdb und .cif.
Sicherheit
RISIKO: LOWEine XYZ-Datei ist reiner Text, der nur Atombezeichnungen und Zahlen enthält - kein ausführbarer Inhalt, keine Makros - daher ist das Öffnen im Wesentlichen harmlos. Der einzige praktische Vorbehalt ist eine Verwechslung: Eine .xyz-Datei könnte tatsächlich GPS/Vermessungsdaten oder ein Wii-Spielebild anstelle eines Moleküls sein; in diesem Fall wird ein Chemie-Viewer scheitern oder Unsinn anzeigen. Laden Sie Chemie-Tools von deren offiziellen Seiten (avogadro.cc, openbabel.org) herunter.
Formatdetails
kurz gefasst- GPS / Vermessungspunktdaten (.xyz) - Eine Textliste von Rechtswert/Hochwert/Höhe oder Längengrad/Breitengrad/Höhe, die von GIS- und Vermessungswerkzeugen verwendet wird; strukturell lediglich durch Trennzeichen getrennte Zahlen, keine Chemie.
- Nintendo Wii Bild (.xyz) - Ein RLE-komprimiertes indiziertes Bitmap-Bildformat, das in einigen Wii-Spielen vorkommt; nicht verwandt mit dem Molekularformat.
Programme zum Öffnen von XYZ-Dateien
Windows4 apps
Avogadro
Open Source Öffnen Sie die .xyz, um das Molekül in 3D zu rendern; rotieren, messen, bearbeiten und in andere Formate exportieren. Kostenlos, empfohlen. 
Jmol
Open Source Öffnen Sie die .xyz, um die Struktur anzuzeigen und zu animieren (ideal für Trajektorien). Kostenloser Java-Viewer. 
VMD
Kostenlos Laden Sie die .xyz für die molekulare Visualisierung und Trajektorien-Wiedergabe (stark für MD).
Notepad / any text editor
Open Source Öffnen Sie die .xyz, um die Rohkoordinaten direkt zu lesen/bearbeiten (es ist reiner Text). 
macOS2 apps
Avogadro
Open Source Öffnen Sie die .xyz, um das Molekül in 3D zu rendern; rotieren, messen, bearbeiten und in andere Formate exportieren. Kostenlos, empfohlen. 
Linux2 apps
Avogadro
Open Source Öffnen Sie die .xyz, um das Molekül in 3D zu rendern; rotieren, messen, bearbeiten und in andere Formate exportieren. Kostenlos, empfohlen.
MolView
Kostenlos Fügen Sie XYZ-Koordinaten ein oder importieren Sie diese, um das Molekül ohne Installation im Browser in 3D zu betrachten. Technische Details
technische Spezifikation| MIME-Typ | chemical/x-xyz |
| Alternativer MIME-Typ | text/plain |
| Kodierung | Klartext - ASCII oder UTF-8 |
| Dateistruktur | Zeile 1: Ganzzahl Atomanzahl; Zeile 2: freier Kommentar; jede folgende Zeile: Elementsymbol und drei Gleitkommawerte für x, y, z |
| Koordinateneinheit | Standardmäßig Angström (Å) |
| Koordinatensystem | Kartesisch (absolute x-, y-, z-Positionen) |
| Bindungsdaten | Nicht gespeichert; nur Elementsymbole und Atompositionen werden aufgezeichnet |
| Erweiterte Variante | Extended XYZ (extxyz): key=value Metadaten-Paare und ein Lattice=-Tensor in der Kommentarzeile |
| Multi-Frame-Unterstützung | Ja - mehrere hintereinandergefügte Koordinatenblöcke in einer Datei bilden eine Trajektorie oder Animation |
| Dateisignatur | Keine (keine Magic Bytes); identifiziert durch eine Ganzzahl in der ersten Zeile, gefolgt von einem Kommentar und Elementsymbol-Zeilen |
| Kompression | Standardmäßig unkomprimiert; große Trajektorien werden häufig mit gzip als .xyz.gz komprimiert |
| Typische Dateigröße | Einige hundert Bytes für kleine Moleküle; hunderte MB für lange Molekulardynamik-Trajektorien |
| Plattform | Plattformübergreifend - identisches Format auf Windows, macOS und Linux |
| Ursprung | XMol Molekülvisualisierungsprogramm, Minnesota Supercomputer Center, frühe 1990er Jahre |
| Veröffentlicht | Early 1990s (XMol) |
| Neueste Version | No formal version - a stable de facto text format; 'extended XYZ' adds metadata |
| Offener Standard | Ja · lizenzgebührenfrei |
| Spezifikation | en.wikipedia.org |
XYZ-Konvertierungen
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