Wat is het TDT-bestandsformaat?
.tdt-bestanden bevatten THOR Data Tree-records - het uitwisselingsformaat van het THOR-chemische databasesysteem van Daylight Chemical Information Systems. .tdt-bestanden worden gebruikt voor het uitwisselen van chemische informatie in gestandaardiseerde vorm tussen programma's die verschillende talen of syntaxis gebruiken, waardoor TDT een platformonafhankelijk formaat voor het delen van gegevens is.
.tdt-bestanden slaan gegevens op in platte tekst. Hun aangepaste *datatree*-syntaxis maakt de inhoud echter vrijwel onleesbaar voor de gemiddelde persoon zonder een geschikte converter. Elk record is verankerd door een root SMILES-structuurstring, gevolgd door getagde data-items (eigenschappen, namen, kruisverwijzingen) afgesloten met een |-teken - waarbij vele eigenschappen aan één verbinding worden gekoppeld in de „thesaurus”-stijl waarnaar THOR is vernoemd.
TDT is in de algemene cheminformatica grotendeels vervangen door SDF en platte SMILES-bestanden, die een bredere ondersteuning in tools hebben. Het laden en bevragen van .tdt-bestanden vereist de THOR-Merlin-software of Toolkit van Daylight; een tekstverwerker toont de ruwe getagde structuur, maar kan deze niet interpreteren zonder aanvullende verwerking.
Beveiliging & veiligheid
RISICO: LOWEen .tdt is passieve tekstdata, niet uitvoerbaar, dus het risico bij openen is laag. De realistische zorgen zijn praktisch: het is een niche Daylight-specifiek formaat, dus zonder THOR/Merlin of de Daylight Toolkit kunt u alleen de ruwe tekst lezen, niet met de chemie werken; en chemische datasets kunnen eigendom/vertrouwelijk zijn, dus behandel geëxporteerde THOR-gegevens volgens het gegevensbeleid van uw organisatie.
Formaatdetails
in een notendop- Tab-Delimited Text data-export - Sommige applicaties gebruiken .tdt als een generiek door tabs gescheiden tekstbestand; open in Excel of een tekstverwerker - niet gerelateerd aan Daylight THOR.
- Applicatiespecifieke gegevens/sjabloonbestanden - Een paar programma's hergebruiken .tdt voor hun eigen gegevens of sjabloonbestanden; controleer de producerende applicatie.
Programma's die TDT-bestanden openen
Windows2 apps
Daylight Toolkit / THOR-Merlin
Betaald Laad/bevraag de .tdt met Daylight's THOR-Merlin databasetools (de systeemeigen, bedoelde manier).
Notepad++ (read raw)
Open-source Open de .tdt om de ruwe datatree-tekst te inspecteren (SMILES + getagde velden); het zal de chemie niet interpreteren. 
macOS1 app
Any text editor (read raw)
Gratis Open de .tdt als tekst om de records te bekijken; gebruik Daylight-tools voor het daadwerkelijke laden/bevragen. 
Linux1 app
Daylight Toolkit + text tools
Betaald Gebruik de Daylight Toolkit/THOR op Unix/Linux om de datatree te laden; inspecteer ruwe tekst met less/vim. Technische details
diepe specificaties| Formaattype | Tekstgebaseerd chemisch informatiebestand (THOR datatree-syntaxis) |
| Ontwikkelaar | Daylight Chemical Information Systems, Inc. |
| Codering | ASCII platte tekst |
| Compressie | Geen (THOR-database gebruikt geïndexeerde opslag; de TDT-uitwisselingsvorm is ongecomprimeerde tekst) |
| Typische grootte | KB tot vele MB (afhankelijk van het aantal verbinding-records) |
| Bijbehorend OS | Unix, Linux, Windows (met Daylight Toolkit / THOR-Merlin) |
| Recordstructuur | SMILES root-identificatie + getagde data-items (eigenschappen, namen, kruisverwijzingen) + | record-afsluiter |
| SMILES root | Elke datatree is gekoppeld aan een SMILES- of SMIRKS-string die de verbinding identificeert op basis van structuur |
| Datatree-concept | Meerdere eigenschappen (thesaurus-items) gekoppeld aan één verbindings-root vormen de doorzoekbare database van THOR |
| MIME-type | text/plain (geen geregistreerd MIME-type) |
| Tool-vereiste | Daylight Toolkit of THOR-Merlin vereist voor laden en bevragen; tekstverwerkers tonen alleen ruwe inhoud |
| Huidige status | Grotendeels vervangen door SDF/MOL en platte SMILES-bestanden in de algemene cheminformatica; blijft in gebruik op THOR-Merlin-locaties |
| Specificatie | Gedefinieerd door de Daylight datatree-specificatie op daylight.com |
| Uitgebracht | With Daylight's THOR/Merlin chemical database system (1990s) |
| Laatste versie | Tied to the Daylight Toolkit / THOR-Merlin release |
| Specificatie | www.daylight.com |
TDT conversies
Community V&A
gevraagd door gebruikersNog geen vragen - wees de eerste om iets te vragen over TDT-bestanden.
