.TDT

TDT ファイル

THOR Data Tree File
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TDT ファイルは THOR Data Tree であり、Daylight Chemical Information Systems による化学情報レコードです。各レコードは、化学構造(SMILES 文字列)を名前、特性、登録番号などのタグ付きフィールドに関連付けます。Daylight の THOR-Merlin ツールでネイティブに開くことができます。テキストエディタでは生のテキストが表示されますが、化学的性質を解釈することはできません。

開発元: Daylight Chemical Information Systems, Inc. カテゴリ: データファイル MIME: text/plain
対応OS Windows macOS Linux
関連: .PKPASS · .DAT · .JSON · .RIS

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最終確認日:Jul 24, 2026

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TDT ファイル形式とは?

.tdt ファイルには THOR Data Tree レコードが含まれています。これは Daylight Chemical Information Systems の THOR 化学データベースの交換形式です。.tdt ファイルは、異なる言語や構文を使用するプログラム間で標準化された形式で化学情報を交換するために使用され、TDT はマルチプラットフォームのデータ共有形式となっています。

.tdt ファイルはプレーンテキストでデータを保存します。しかし、独自の «datatree» 構文により、適切なコンバータがない限り、一般の人には内容が事実上判読不能です。各レコードはルートとなる SMILES 構造文字列によって固定され、その後にタグ付きデータ項目(特性、名前、相互参照)が続き、| 文字で終了します。これにより、THOR の名前の由来である «thesaurus»(シソーラス)形式で、多くの特性が1つの化合物にリンクされます。

一般のケモインフォマティクスにおいて、TDT はより広範なツールサポートを持つ SDF やフラットな SMILES ファイルに大きく取って代わられています。.tdt ファイルの読み込みやクエリには Daylight の THOR-Merlin ソフトウェアまたは Toolkit が必要です。テキストエディタではタグ付きの生の構造が表示されますが、追加の処理なしにそれを解釈することはできません。

セキュリティと安全性

リスク: LOW

.tdt はパッシブなテキストデータであり、実行可能ではないため、開く際のリスクは低いです。現実的な懸念は実用面です。これは Daylight 固有のニッチな形式であるため、THOR/Merlin や Daylight Toolkit がないと生のテキストしか読めず、化学データを扱うことはできません。また、化学データセットは機密情報である可能性があるため、エクスポートされた THOR データは組織のデータポリシーに従って取り扱ってください。

形式の詳細

概要
正式名称THOR Data Tree File別名 THOR datatree, Daylight TDT file
開発元Daylight Chemical Information Systems, Inc.登場時期 With Daylight's THOR/Merlin chemical database system (1990s)
MIME タイプtext/plain
タイプテキストベースの化学情報レコード(独自の THOR データツリー構文)
この拡張子は以下でも使用されています…
  • タブ区切りテキストデータエクスポート - 一部のアプリケーションは、汎用的なタブ区切りテキストデータファイルとして .tdt を使用します。Excel やテキストエディタで開きます。Daylight THOR とは無関係です。
  • アプリケーション固有のデータ/テンプレートファイル - いくつかのプログラムが独自のデータやテンプレートファイルに .tdt を再利用しています。作成元のアプリケーションを確認してください。

TDT ファイルを開くプログラム

Windows2 apps
Daylight Toolkit / THOR-Merlin 有料 Daylight の THOR-Merlin データベースツールを使用して .tdt を読み込み/クエリします(ネイティブで意図された方法)。
Notepad++ (read raw) オープンソース .tdt を開いて生のデータツリーテキスト(SMILES + タグ付きフィールド)を確認します。化学的性質は解釈されません。
macOS1 app
Any text editor (read raw) 無料 .tdt をテキストとして開き、レコードを表示します。実際の読み込みやクエリには Daylight ツールを使用してください。
Linux1 app
Daylight Toolkit + text tools 有料 Unix/Linux 上で Daylight Toolkit/THOR を使用してデータツリーを読み込みます。less や vim で生のテキストを確認します。

技術的詳細

詳細仕様
フォーマットタイプテキストベースの化学情報レコード(THOR データツリー構文)
開発者Daylight Chemical Information Systems, Inc.
エンコーディングASCII プレーンテキスト
圧縮なし(THOR データベースはインデックス付きストレージを使用しますが、TDT 交換形式は非圧縮テキストです)
標準的なサイズKB から 数百 MB(化合物レコードの数に依存)
関連 OSUnix, Linux, Windows (Daylight Toolkit / THOR-Merlin 使用時)
レコード構造SMILES ルート識別子 + タグ付きデータ項目(特性、名前、相互参照)+ | レコード終端記号
SMILES ルート各データツリーは、構造によって化合物を識別する SMILES または SMIRKS 文字列をキーとしています
データツリーの概念1つの化合物ルートに付随する複数の特性(シソーラスエントリ)が、THOR の検索可能なデータベースを構成します
MIME タイプtext/plain (未登録の MIME)
ツールの要件読み込みとクエリには Daylight Toolkit または THOR-Merlin が必要です。テキストエディタでは生の内容のみが表示されます
現在のステータス一般的なケモインフォマティクスでは SDF/MOL やフラットな SMILES ファイルに大きく取って代わられていますが、THOR-Merlin 導入サイトでは残っています
仕様daylight.com の Daylight データツリー仕様によって定義されています
リリース日With Daylight's THOR/Merlin chemical database system (1990s)
最新バージョンTied to the Daylight Toolkit / THOR-Merlin release
仕様書www.daylight.com

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よくある質問

TDT ファイルとは何ですか?
これは THOR Data Tree です。Daylight Chemical Information Systems の THOR/Merlin データベースからの化学情報レコードです。各レコードは化学構造(SMILES 文字列)を多くのタグ付きデータフィールドにリンクします。
TDT ファイルを開くにはどうすればよいですか?
Daylight の THOR-Merlin ツールまたは Daylight Toolkit を使用してネイティブに開きます。また、任意のテキストエディタで開いて生のデータツリーを読むこともできますが、エディタは化学的性質を解釈しません。
なぜ TDT ファイルは人間が読める形式ではないのですか?
プレーンテキストではありますが、Daylight 独自のデータツリー構文(SMILES ルートとタグ付きデータ項目、レコードの末尾は «|»)を使用しているためです。これはソフトウェアによる読み込み用に設計されており、カジュアルな閲覧用ではありません。
TDT を SDF や SMILES に変換できますか?
はい、手間はかかりますが可能です。SMILES を抽出し .smi ファイルにするか、Daylight Toolkit や解析スクリプトを使用してレコードを SDF/MOL に変換します(その後 RDKit や Open Babel を使用)。構造データは問題なく移行できますが、関連フィールドのマッピングが必要です。
TDT はタブ区切りテキストファイル(tab-delimited text)と同じですか?
このデータベースにおいては違います。ここでの .tdt は Daylight の THOR Data Tree です。他のプログラムの中には、タブ区切りテキストの汎用的な拡張子として .tdt を使用するものもありますが、それらは無関係であり、Excel で正常に開くことができます。
どのソフトウェアが私の TDT ファイルを作成したのでしょうか?
ほぼ間違いなく Daylight の THOR/Merlin 化学データベースシステムです。化学以外のアプリからのものである場合は、たまたま同じ拡張子を共有している汎用的なタブ区切りデータエクスポートである可能性が高いです。

参考文献

1Daylight - THOR (Thesaurus Oriented Retrieval) theorywww.daylight.com
2Daylight - Merlin high-speed searchwww.daylight.com

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1.AQQAQQ Instant Messenger File
2.CRDOWNLOADChrome Partial Download File
3.DATProgram Data File (generic)
4.JPGJPEG Image
5.RPMSGRestricted Permission Message
6.EXEWindows Executable (Portable Executable)
7.JSONJavaScript Object Notation file
8.PARTPartial Download File
9.BINCD/DVD Disc Image (BIN/CUE)
10.DBSQLite Database File

関連する拡張子

.PKPASSApple Wallet Pass (formerly Passbook)
.DATProgram Data File (generic)
.JSONJavaScript Object Notation file
.RISResearch Information Systems citation file
.OFXOpen Financial Exchange
.CSVComma-Separated Values

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