Co to jest format pliku TDT?
Pliki .tdt zawierają rekordy THOR Data Tree - format wymiany bazy danych chemicznych THOR firmy Daylight Chemical Information Systems. Pliki .tdt są używane do wymiany informacji chemicznych w standaryzowanej formie między programami korzystającymi z różnych języków lub składni, co czyni TDT wieloplatformowym formatem udostępniania danych.
Pliki .tdt zapisują dane w formacie tekstowym. Jednak ich niestandardowa składnia *datatree* sprawia, że zawartość jest praktycznie nieczytelna dla przeciętnego użytkownika bez odpowiedniego konwertera. Każdy rekord jest zakotwiczony przez główny ciąg struktury SMILES, po którym następują otagowane elementy danych (właściwości, nazwy, odsyłacze) zakończone znakiem | - co łączy wiele właściwości z jednym związkiem w stylu „tezaurusa”, od którego pochodzi nazwa THOR.
TDT został w dużej mierze zastąpiony w ogólnej cheminformatyce przez pliki SDF i płaskie pliki SMILES, które mają szersze wsparcie narzędziowe. Ładowanie i odpytywanie plików .tdt wymaga oprogramowania THOR-Merlin lub Toolkit firmy Daylight; edytor tekstu pokazuje surową, otagowaną strukturę, ale nie może jej zinterpretować bez dodatkowego przetwarzania.
Bezpieczeństwo
RYZYKO: LOWPlik .tdt to pasywne dane tekstowe, nie jest wykonywalny, więc otwarcie go wiąże się z niskim ryzykiem. Realne obawy są praktyczne: jest to niszowy format specyficzny dla Daylight, więc bez THOR/Merlin lub Daylight Toolkit można jedynie odczytać surowy tekst, a nie pracować z chemią; zestawy danych chemicznych mogą być zastrzeżone/poufne, więc należy obchodzić się z wyeksportowanymi danymi THOR zgodnie z polityką danych organizacji.
Szczegóły formatu
w pigułce- Eksport danych tekstowych rozdzielanych tabulatorami - Niektóre aplikacje używają .tdt jako ogólnego pliku danych tekstowych rozdzielanych tabulatorami; otwórz w Excel lub edytorze tekstu - niepowiązane z Daylight THOR.
- Pliki danych/szablonów specyficzne dla aplikacji - Kilka programów ponownie wykorzystuje rozszerzenie .tdt dla własnych plików danych lub szablonów; sprawdź aplikację generującą plik.
Programy otwierające pliki TDT
Windows2 apps
Daylight Toolkit / THOR-Merlin
Płatny Ładuj/odpytuj .tdt za pomocą narzędzi bazy danych THOR-Merlin firmy Daylight (sposób natywny, zamierzony).
Notepad++ (read raw)
Open-source Otwórz .tdt, aby sprawdzić surowy tekst drzewa danych (SMILES + otagowane pola); nie zinterpretuje to chemii. 
macOS1 app
Any text editor (read raw)
Darmowy Otwórz .tdt jako tekst, aby wyświetlić rekordy; użyj narzędzi Daylight do rzeczywistego ładowania/odpytywania. 
Linux1 app
Daylight Toolkit + text tools
Płatny Użyj Daylight Toolkit/THOR na Unix/Linux, aby załadować drzewo danych; sprawdź surowy tekst za pomocą less/vim. Szczegóły techniczne
specyfikacja| Typ formatu | Tekstowy rekord informacji chemicznych (składnia THOR datatree) |
| Deweloper | Daylight Chemical Information Systems, Inc. |
| Kodowanie | Zwykły tekst ASCII |
| Kompresja | Brak (baza danych THOR używa indeksowanego przechowywania; forma wymiany TDT to nieskompresowany tekst) |
| Typowy rozmiar | Od KB do wielu MB (zależy od liczby rekordów związków) |
| Powiązany system operacyjny | Unix, Linux, Windows (z Daylight Toolkit / THOR-Merlin) |
| Struktura rekordu | Identyfikator główny SMILES + otagowane elementy danych (właściwości, nazwy, odsyłacze) + | terminator rekordu |
| Korzeń SMILES | Każde drzewo danych jest kluczowane przez ciąg SMILES lub SMIRKS identyfikujący związek poprzez strukturę |
| Koncepcja drzewa danych | Wiele właściwości (wpisów tezaurusa) dołączonych do jednego korzenia związku tworzy przeszukiwalną bazę danych THOR |
| Typ MIME | text/plain (brak zarejestrowanego MIME) |
| Wymagane narzędzia | Daylight Toolkit lub THOR-Merlin wymagane do ładowania i odpytywania; edytory tekstu pokazują tylko surową zawartość |
| Aktualny status | W dużej mierze zastąpiony przez pliki SDF/MOL i płaskie pliki SMILES w ogólnej cheminformatyce; pozostaje w użyciu w ośrodkach korzystających z THOR-Merlin |
| Specyfikacja | Zdefiniowana przez specyfikację Daylight datatree na stronie daylight.com |
| Wydano | With Daylight's THOR/Merlin chemical database system (1990s) |
| Najnowsza wersja | Tied to the Daylight Toolkit / THOR-Merlin release |
| Specyfikacja | www.daylight.com |
Konwersje TDT
Pytania i odpowiedzi społeczności
pytania użytkownikówBrak pytań - bądź pierwszą osobą, która zapyta o pliki TDT.
