Che cos'è il formato di file TDT?
I file .tdt contengono record THOR Data Tree - il formato di scambio del database chimico THOR di Daylight Chemical Information Systems. I file .tdt sono utilizzati per scambiare informazioni chimiche in forma standardizzata tra programmi che utilizzano linguaggi o sintassi differenti, rendendo il TDT un formato di condivisione dati multipiattaforma.
I file .tdt salvano i dati in testo semplice. Tuttavia, la loro sintassi personalizzata *datatree* rende i contenuti virtualmente illeggibili per una persona media senza un convertitore appropriato. Ogni record è ancorato da una stringa di struttura radice SMILES, seguita da elementi di dati etichettati (proprietà, nomi, riferimenti incrociati) terminati da un carattere | - collegando molte proprietà a un singolo composto nello stile «thesaurus» da cui THOR prende il nome.
Il TDT è stato ampiamente sostituito nella chemioinformatica generale dai file SDF e SMILES piatti, che godono di un supporto software più ampio. Il caricamento e l'interrogazione dei file .tdt richiedono il software o il Toolkit THOR-Merlin di Daylight; un editor di testo mostra la struttura etichettata grezza ma non può interpretarla senza un'elaborazione aggiuntiva.
Sicurezza e incolumità
RISCHIO: LOWUn .tdt è un dato testuale passivo, non eseguibile, quindi l'apertura è a basso rischio. Le preoccupazioni realistiche sono pratiche: è un formato di nicchia specifico di Daylight, quindi senza THOR/Merlin o il Daylight Toolkit è possibile solo leggere il testo grezzo, non lavorare con la chimica; inoltre, i set di dati chimici possono essere proprietari/riservati, quindi gestite i dati THOR esportati secondo la politica sui dati della vostra organizzazione.
Dettagli del formato
in sintesi- Esportazione dati Tab-Delimited Text - Alcune applicazioni utilizzano .tdt come file di dati di testo generico delimitato da tabulazioni; apritelo in Excel o in un editor di testo - non correlato a Daylight THOR.
- File di dati/modelli specifici dell'applicazione - Alcuni programmi riutilizzano .tdt per i propri file di dati o modelli; controllare l'applicazione di origine.
Programmi che aprono file TDT
Windows2 apps
Daylight Toolkit / THOR-Merlin
A pagamento Carica/interroga il .tdt con gli strumenti del database THOR-Merlin di Daylight (il modo nativo previsto).
Notepad++ (read raw)
Open-source Apri il .tdt per ispezionare il testo grezzo del datatree (SMILES + campi etichettati); non interpreterà la chimica. 
macOS1 app
Any text editor (read raw)
Gratuito Apri il .tdt come testo per visualizzare i record; usa gli strumenti Daylight per il caricamento/interrogazione effettivi. 
Linux1 app
Daylight Toolkit + text tools
A pagamento Usa il Daylight Toolkit/THOR su Unix/Linux per caricare il datatree; ispeziona il testo grezzo con less/vim. Dettagli tecnici
specifiche approfondite| Tipo di formato | Record di informazioni chimiche basato su testo (sintassi THOR datatree) |
| Sviluppatore | Daylight Chemical Information Systems, Inc. |
| Codifica | Testo semplice ASCII |
| Compressione | Nessuna (il database THOR utilizza l'archiviazione indicizzata; il formato di scambio TDT è testo non compresso) |
| Dimensione tipica | Da KB a molti MB (dipende dal numero di record dei composti) |
| OS associato | Unix, Linux, Windows (con Daylight Toolkit / THOR-Merlin) |
| Struttura del record | Identificatore radice SMILES + elementi dati etichettati (proprietà, nomi, rif. incrociati) + terminatore di record | |
| Radice SMILES | Ogni datatree è indicizzato da una stringa SMILES o SMIRKS che identifica il composto per struttura |
| Concetto di Datatree | Proprietà multiple (voci di thesaurus) collegate a una radice di composto formano il database ricercabile di THOR |
| Tipo MIME | text/plain (nessun MIME registrato) |
| Requisiti software | Daylight Toolkit o THOR-Merlin richiesti per il caricamento e l'interrogazione; gli editor di testo mostrano solo il contenuto grezzo |
| Stato attuale | Ampiamente sostituito da file SDF/MOL e SMILES piatti nella chemioinformatica generale; rimane in uso presso i siti THOR-Merlin |
| Specifica | Definito dalla specifica datatree di Daylight su daylight.com |
| Rilasciato | With Daylight's THOR/Merlin chemical database system (1990s) |
| Ultima versione | Tied to the Daylight Toolkit / THOR-Merlin release |
| Specifica | www.daylight.com |
Conversioni TDT
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