O que é o formato de ficheiro TDT?
Arquivos .tdt contêm registros THOR Data Tree - o formato de intercâmbio do banco de dados químico THOR da Daylight Chemical Information Systems. Os arquivos .tdt são usados para trocar informações químicas em formato padronizado entre programas que usam diferentes linguagens ou sintaxes, tornando o TDT um formato de compartilhamento de dados multiplataforma.
Os arquivos .tdt salvam dados em texto simples. No entanto, sua sintaxe personalizada *datatree* torna o conteúdo virtualmente ilegível para a pessoa comum sem um conversor adequado. Cada registro é ancorado por uma string de estrutura SMILES raiz, seguida por itens de dados marcados (propriedades, nomes, referências cruzadas) terminados por um caractere | - vinculando muitas propriedades a um único composto no estilo «thesaurus» pelo qual o THOR é nomeado.
O TDT foi amplamente substituído na quimioinformática geral pelos arquivos SDF e SMILES simples, que possuem suporte de ferramentas mais amplo. Carregar e consultar arquivos .tdt requer o software ou Toolkit THOR-Merlin da Daylight; um editor de texto mostra a estrutura marcada bruta, mas não pode interpretá-la sem processamento adicional.
Segurança e proteção
RISCO: LOWUm .tdt consiste em dados de texto passivos, não executáveis, portanto o risco ao abrir é baixo. As preocupações reais são práticas: é um formato de nicho específico da Daylight, portanto, sem o THOR/Merlin ou o Daylight Toolkit, você só poderá ler o texto bruto, não trabalhar com a química; e conjuntos de dados químicos podem ser proprietários/confidenciais, portanto, manuseie os dados THOR exportados de acordo com a política de dados da sua organização.
Detalhes do formato
em resumo- Exportação de dados de texto delimitado por tabulação - Alguns aplicativos usam .tdt como um arquivo de dados de texto genérico delimitado por tabulação; abra no Excel ou em um editor de texto - não relacionado ao Daylight THOR.
- Arquivos de dados/modelos específicos de aplicativos - Alguns programas reutilizam .tdt para seus próprios arquivos de dados ou modelos; verifique o aplicativo de origem.
Programas que abrem arquivos TDT
Detalhes técnicos
especificação profunda| Tipo de formato | Registro de informações químicas baseado em texto (sintaxe THOR datatree) |
| Desenvolvedor | Daylight Chemical Information Systems, Inc. |
| Codificação | Texto simples ASCII |
| Compressão | Nenhuma (o banco de dados THOR usa armazenamento indexado; a forma de intercâmbio TDT é texto não compactado) |
| Tamanho típico | KB a muitos MB (depende do número de registros de compostos) |
| SO associado | Unix, Linux, Windows (com Daylight Toolkit / THOR-Merlin) |
| Estrutura do registro | Identificador de raiz SMILES + itens de dados marcados (propriedades, nomes, referências cruzadas) + terminador de registro | |
| Raiz SMILES | Cada datatree é chaveada por uma string SMILES ou SMIRKS identificando o composto pela estrutura |
| Conceito de datatree | Múltiplas propriedades (entradas de thesaurus) anexadas a uma raiz de composto formam o banco de dados pesquisável do THOR |
| Tipo MIME | text/plain (nenhum MIME registrado) |
| Requisito de ferramenta | Daylight Toolkit ou THOR-Merlin necessário para carregamento e consulta; editores de texto mostram apenas o conteúdo bruto |
| Status atual | Amplamente substituído por arquivos SDF/MOL e SMILES simples na quimioinformática geral; permanece em sites que utilizam THOR-Merlin |
| Especificação | Definido pela especificação datatree da Daylight em daylight.com |
| Lançado | With Daylight's THOR/Merlin chemical database system (1990s) |
| Versão mais recente | Tied to the Daylight Toolkit / THOR-Merlin release |
| Especificação | www.daylight.com |
Conversões de TDT
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