Was ist das TDT-Dateiformat?
.tdt-Dateien enthalten THOR Data Tree-Datensätze - das Austauschformat des THOR-Chemiedatenbanksystems von Daylight Chemical Information Systems. .tdt-Dateien werden für den Austausch chemischer Informationen in standardisierter Form zwischen Programmen verwendet, die unterschiedliche Sprachen oder Syntaxen nutzen, was TDT zu einem plattformübergreifenden Datenaustauschformat macht.
.tdt-Dateien speichern Daten im Klartext. Aufgrund ihrer speziellen *datatree*-Syntax ist der Inhalt für den Durchschnittsnutzer ohne einen geeigneten Konverter jedoch praktisch unlesbar. Jeder Datensatz ist an einer Wurzel-Strukturzeichenfolge im SMILES-Format verankert, gefolgt von markierten Datenelementen (Eigenschaften, Namen, Querverweise), die durch ein |-Zeichen abgeschlossen werden - dies verknüpft viele Eigenschaften mit einer Verbindung im „Thesaurus“-Stil, nach dem THOR benannt ist.
TDT wurde in der allgemeinen Chemoinformatik weitgehend durch SDF und flache SMILES-Dateien ersetzt, die eine breitere Tool-Unterstützung bieten. Das Laden und Abfragen von .tdt-Dateien erfordert die THOR-Merlin-Software oder das Toolkit von Daylight; ein Texteditor zeigt die rohe, markierte Struktur an, kann sie aber ohne zusätzliche Verarbeitung nicht interpretieren.
Sicherheit
RISIKO: LOWEine .tdt-Datei besteht aus passiven Textdaten, ist nicht ausführbar und daher beim Öffnen risikoarm. Die realistischen Bedenken sind praktischer Natur: Es handelt sich um ein nischenspezifisches Daylight-Format. Ohne THOR/Merlin oder das Daylight Toolkit können Sie nur den Rohtext lesen, aber nicht mit der Chemie arbeiten; zudem können chemische Datensätze proprietär/vertraulich sein, behandeln Sie exportierte THOR-Daten daher gemäß der Datenrichtlinie Ihrer Organisation.
Formatdetails
kurz gefasst- Tab-Delimited Text Datenexport - Einige Anwendungen verwenden .tdt als generische tabulatorgetrennte Textdatendatei; öffnen Sie diese in Excel oder einem Texteditor - kein Zusammenhang mit Daylight THOR.
- Anwendungsspezifische Daten-/Vorlagendateien - Einige Programme verwenden .tdt für ihre eigenen Daten- oder Vorlagendateien; prüfen Sie die erzeugende Anwendung.
Programme zum Öffnen von TDT-Dateien
Windows2 apps
Daylight Toolkit / THOR-Merlin
Kostenpflichtig Laden/Abfragen der .tdt mit den THOR-Merlin-Datenbanktools von Daylight (der native, vorgesehene Weg).
Notepad++ (read raw)
Open Source Öffnen Sie die .tdt, um den rohen Datatree-Text zu inspizieren (SMILES + markierte Felder); die Chemie wird nicht interpretiert. 
macOS1 app
Any text editor (read raw)
Kostenlos Öffnen Sie die .tdt als Text, um die Datensätze anzuzeigen; verwenden Sie Daylight-Tools für das tatsächliche Laden/Abfragen. 
Linux1 app
Daylight Toolkit + text tools
Kostenpflichtig Verwenden Sie das Daylight Toolkit/THOR unter Unix/Linux, um den Datatree zu laden; inspizieren Sie den Rohtext mit less/vim. Technische Details
technische Spezifikation| Format-Typ | Textbasierter Datensatz für chemische Informationen (THOR-Datatree-Syntax) |
| Entwickler | Daylight Chemical Information Systems, Inc. |
| Kodierung | ASCII-Klartext |
| Kompression | Keine (THOR-Datenbank verwendet indizierten Speicher; die TDT-Austauschform ist unkomprimierter Text) |
| Typische Größe | KB bis viele MB (abhängig von der Anzahl der Verbindungsdatensätze) |
| Zugehöriges OS | Unix, Linux, Windows (mit Daylight Toolkit / THOR-Merlin) |
| Datensatzstruktur | SMILES-Wurzelidentifikator + markierte Datenelemente (Eigenschaften, Namen, Querverweise) + | Datensatz-Abschlusszeichen |
| SMILES-Wurzel | Jeder Datatree ist durch einen SMILES- oder SMIRKS-String verschlüsselt, der die Verbindung über die Struktur identifiziert |
| Datatree-Konzept | Mehrere Eigenschaften (Thesaurus-Einträge), die an eine Verbindungswurzel angehängt sind, bilden die durchsuchbare Datenbank von THOR |
| MIME-Typ | text/plain (kein registrierter MIME-Typ) |
| Tool-Anforderung | Daylight Toolkit oder THOR-Merlin zum Laden und Abfragen erforderlich; Texteditoren zeigen nur Rohinhalt |
| Aktueller Status | In der allgemeinen Chemoinformatik weitgehend durch SDF/MOL und flache SMILES-Dateien ersetzt; verbleibt an THOR-Merlin-Standorten |
| Spezifikation | Definiert durch die Daylight-Datatree-Spezifikation auf daylight.com |
| Veröffentlicht | With Daylight's THOR/Merlin chemical database system (1990s) |
| Neueste Version | Tied to the Daylight Toolkit / THOR-Merlin release |
| Spezifikation | www.daylight.com |
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