Por que converter DCM para NIFTI?
O DICOM armazena cada fatia de MRI ou CT como um arquivo .dcm separado, enquanto ferramentas de análise de neuroimagem como FSL, SPM, FreeSurfer e ANTs esperam um único volume NIfTI por exame. A conversão agrupa toda a série 3D em um único arquivo .nii ou .nii.gz, simplificando o gerenciamento do pipeline e tornando os dados imediatamente utilizáveis para segmentação cerebral, análise de fMRI e morfometria baseada em voxel.
Como converter DCM para NIFTI
dcm2niix OPEN-SOURCE
Execute dcm2niix -o /output -f %p_%s /dicom_folder em um terminal; ele ordena as fatias, grava um .nii.gz por série e produz automaticamente um arquivo JSON compatível com BIDS.
3D Slicer OPEN-SOURCE
Importe a série DICOM através do módulo DICOM, carregue a série desejada, use Arquivo > Salvar e selecione o formato NIfTI .nii.gz.
MRIcroGL FREE
Vá em Import > Convert DICOM to NIfTI, selecione a pasta DICOM de entrada e a pasta de saída, e clique em Convert - o MRIcroGL executa o dcm2niix internamente.
Sobre estes formatos
.DCM
DICOM Medical Image
Um arquivo DCM é uma imagem médica DICOM - um raio-X, TC, RM, ultrassom ou mamografia - agrupada com informações do paciente e do estudo. Para abri-lo, use um visualizador DICOM gratuito:…
Abrir detalhes de .DCM →Um arquivo .NIFTI é um arquivo de dados usado por um software específico.
Abrir detalhes de .NIFTI →Qualidade e o que observar
- O dcm2niix processa automaticamente múltiplas séries em uma pasta e nomeia cada arquivo de saída separadamente - nenhuma triagem manual é necessária.
- Para uma saída NIfTI não compactada em vez de
.nii.gz, adicione-z nao comando dcm2niix. - Verifique a orientação e a cobertura do volume de saída no FSLeyes ou MRIcroGL antes de passá-lo para um pipeline de análise.
Perguntas frequentes
Por que o NIfTI é preferido em relação ao DICOM para pesquisa em neuroimagem?
.dcm; todas as principais ferramentas de neuroimagem o leem nativamente.
