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DCM NIFTI
Conversion de fichier

Convertir DCM en NIFTI

Vérifié par Adam B.· révisé par FE Editorial ·mis à jour Aug 18, 2026
RÉPONSE RAPIDE
Est-il possible de convertir DCM en NIFTI ?
Oui - DCM se convertit en NIFTI.

Pointez dcm2niix vers le dossier contenant toutes les coupes .dcm et il génère un fichier .nii.gz ainsi qu'un fichier d'accompagnement JSON avec les paramètres d'acquisition. Aucune qualité d'image n'est perdue. Si vous préférez une interface graphique, 3D Slicer et MRIcroGL intègrent tous deux dcm2niix.

Aussi vers NIFTI : DICOM

Sur cette page

Testé sur macOS, Windows et Linux
Dernière vérification le Oct 2026

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Pourquoi convertir DCM en NIFTI ?

Le format DICOM stocke chaque coupe d'IRM ou de scanner comme un fichier .dcm séparé, tandis que les outils d'analyse en neuroimagerie tels que FSL, SPM, FreeSurfer et ANTs attendent un seul volume NIfTI par examen. La conversion regroupe toute la série 3D dans un seul fichier .nii ou .nii.gz, simplifiant la gestion des pipelines et rendant les données immédiatement utilisables pour la segmentation cérébrale, l'analyse fMRI et la morphométrie basée sur les voxels.

Comment convertir DCM en NIFTI

dcm2niix OPEN-SOURCE

Exécutez dcm2niix -o /output -f %p_%s /dicom_folder dans un terminal ; il trie les coupes, écrit un .nii.gz par série et produit automatiquement un fichier JSON compatible BIDS.

3D Slicer OPEN-SOURCE

Importez la série DICOM via le module DICOM, chargez la série souhaitée, puis utilisez Fichier > Enregistrer et sélectionnez le format NIfTI .nii.gz.

MRIcroGL FREE

Allez dans Import > Convert DICOM to NIfTI, sélectionnez le dossier DICOM d'entrée et le dossier de sortie, puis cliquez sur Convert - MRIcroGL exécute dcm2niix en interne.

À propos de ces formats

.DCM DICOM Medical Image

Un fichier DCM est une image médicale DICOM - une radiographie, un scanner, une IRM, une échographie ou une mammographie - regroupée avec les informations sur le patient et l'examen. Pour…

Ouvrir les détails de .DCM →
.NIFTI NIFTI File

Un fichier .NIFTI est un fichier de données utilisé par un logiciel spécifique.

Ouvrir les détails de .NIFTI →

Qualité et points de vigilance

  • dcm2niix traite automatiquement plusieurs séries dans un même dossier et nomme chaque fichier de sortie séparément - aucun tri manuel n'est requis.
  • Pour une sortie NIfTI non compressée au lieu de .nii.gz, ajoutez -z n à la commande dcm2niix.
  • Vérifiez l'orientation et la couverture du volume de sortie dans FSLeyes ou MRIcroGL avant de le passer à un pipeline d'analyse.

Foire aux questions

Pourquoi le format NIfTI est-il préféré au DICOM pour la recherche en neuroimagerie ?
NIfTI regroupe le volume 3D complet dans un seul fichier, ce qui est plus facile à gérer que des centaines de coupes .dcm ; tous les principaux outils de neuroimagerie le lisent nativement.
Y a-t-il une perte de qualité d'image lors de la conversion ?
Non - dcm2niix effectue une conversion sans perte (lossless), préservant les valeurs de voxels originales et l'orientation spatiale.
Qu'est-ce que le fichier JSON d'accompagnement produit par dcm2niix ?
Un fichier de métadonnées compatible BIDS enregistrant les paramètres d'acquisition tels que le TR, le TE et l'angle de bascule - requis par de nombreux pipelines de neuroimagerie pour le contrôle qualité.