Che cos'è il formato di file CAR?
Un file .car è un file di coordinate cartesiane in formato testo semplice utilizzato nella modellazione molecolare. Ogni file memorizza informazioni sulle posizioni atomiche - nomi degli atomi, coordinate x/y/z, simboli degli elementi, identificatori dei residui e cariche parziali - un record per ogni atomo.
I file .car hanno avuto origine con la suite Biosym Insight II e Discover alla fine degli anni '80 e utilizzano un formato ASCII completamente leggibile dall'uomo. Un file .car si apre con la riga di intestazione !BIOSYM archive 3, seguita da un flag PBC=ON o PBC=OFF; quando le condizioni al contorno periodiche sono attive, segue immediatamente un record della cella unitaria che elenca le dimensioni e gli angoli della cella. Non sono presenti magic bytes binari: l'identificazione si basa su quell'intestazione e sulla presenza di un file .mdf di accompagnamento (definizione molecolare), che contiene la topologia, la connettività dei legami e i tipi di atomi.
I file .car sono normalmente distribuiti come un set abbinato: l'archivio delle coordinate (.car), un file di topologia (.mdf) e un file di campo di forza (.frc) definiscono insieme completamente un modello di simulazione. Lo stesso formato viene scritto anche con l'estensione .arc. La proprietà è passata da Biosym Technologies attraverso MSI (Molecular Simulations Inc.) e Accelrys a BIOVIA (Dassault Systèmes), che legge e scrive tuttora i file .car tramite Materials Studio. Convertitori open source come Open Babel e Avogadro supportano il formato su Windows, Linux e macOS.
Sicurezza e incolumità
RISCHIO: LOWUn file CAR Biosym è un dato di coordinate in testo semplice innocuo - nessun contenuto eseguibile. L'unica cautela nel mondo reale è la confusione d'identità: un file etichettato .car potrebbe in realtà essere un modello di Assetto Corsa o un archivio di gioco (binario), non dati chimici. Se un editor di testo mostra «!BIOSYM archive 3» è il formato delle coordinate; se mostra spazzatura binaria è uno degli altri tipi di .car.
Dettagli del formato
in sintesi- Archivio modelli auto Assetto Corsa (.car) - Pacchetto dati/modello del veicolo utilizzato dalla comunità di modding del simulatore di corse Assetto Corsa; formato binario non correlato.
- Archivio compresso generico (.car) - Vari vecchi archiviatori/giochi utilizzavano .car come contenitore compresso personalizzato (ad esempio alcuni titoli EA); nessuno standard unico.
- File app CazaSoftware / 'Car Explorer' - File specifico dell'app a cui fa riferimento la voce legacy del database «Car Explorer»; oscuro e non è il formato delle coordinate chimiche.
Programmi che aprono file CAR
Windows4 apps
Avogadro
Open-source Editor/visualizzatore molecolare gratuito; apre il .car per visualizzare gli atomi in 3D (tramite il backend Open Babel). 
Open Babel
Open-source Legge/converte il CAR con «obabel input.car -O output.pdb»; anche la versione GUI lo apre. 
BIOVIA Materials Studio
A pagamento Importa il .car (con il suo .mdf) nell'ambiente di modellazione per visualizzare/modificare la struttura. 
macOS1 app
Open Babel / Avogadro
Open-source Installa tramite Homebrew; converte o visualizza il file di coordinate CAR. 
Linux2 apps
Open Babel
Open-source Legge/converte il CAR con «obabel input.car -O output.pdb»; anche la versione GUI lo apre. Dettagli tecnici
specifiche approfondite| Classe del file | Archivio di coordinate cartesiane molecolari in testo semplice (modellazione chimica) |
| Tipo MIME | chemical/x-msi-car |
| Firma dell'intestazione | Testo ASCII «!BIOSYM archive 3» all'offset di byte 0; nessun magic byte binario |
| Flag del contorno periodico | Seconda riga di intestazione: PBC=ON (cristallo/polimero periodico) o PBC=OFF (molecola isolata) |
| Record della cella unitaria | Presente solo quando PBC=ON; specifica le lunghezze del reticolo a, b, c e gli angoli α, β, γ |
| Campi del record atomico | Nome dell'atomo, coordinate cartesiane x/y/z (Å), nome del residuo, simbolo dell'elemento, carica parziale |
| File complementari | .mdf (topologia e connettività) e .frc (parametri del campo di forza); il solo .car non è sufficiente per definire completamente un modello |
| Estensione alternativa | .arc - formato identico; sia .car che .arc sono prodotti da Insight II e Materials Studio |
| Codifica | Testo semplice ASCII a 7 bit; nessuna sezione binaria o dipendenza dall'ordine dei byte |
| Compressione | Nessuna integrata; i file sono comunemente distribuiti compressi con gzip (.car.gz) a causa del testo ripetitivo |
| Dimensione tipica del file | Da 1 KB a pochi MB, scalando linearmente con il numero di atomi |
| Token della versione del formato | «archive 3» incorporato nell'intestazione iniziale; questa revisione è stabile dai primi anni '90 |
| Lignaggio dello sviluppatore | Biosym Technologies → MSI (Molecular Simulations Inc.) → Accelrys → BIOVIA (Dassault Systèmes) |
| Supporto piattaforma | Windows, Linux, macOS - ovunque siano installati BIOVIA Materials Studio, Open Babel, Avogadro o VMD |
| Rilasciato | Late 1980s-1990s (Biosym Insight II / Discover molecular modelling) |
| Ultima versione | Stable legacy format; still read/written by BIOVIA Materials Studio and Open Babel |
| Specifica | openbabel.org |
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