Co to jest format pliku CAR?
Plik .car to tekstowy plik współrzędnych kartezjańskich używany w modelowaniu molekularnym. Każdy plik przechowuje informacje o pozycjach atomowych - nazwy atomów, współrzędne x/y/z, symbole pierwiastków, identyfikatory reszt i ładunki cząstkowe - jeden rekord na atom.
Pliki .car wywodzą się z pakietu Biosym Insight II i Discover z końca lat 80. i wykorzystują w pełni czytelny dla człowieka format ASCII. Plik .car otwiera się linią nagłówka !BIOSYM archive 3, po której następuje flaga PBC=ON lub PBC=OFF; gdy aktywne są periodyczne warunki brzegowe, natychmiast po niej następuje rekord komórki elementarnej zawierający wymiary komórki i kąty. Nie istnieją żadne binarne magic bytes - identyfikacja opiera się na tym nagłówku oraz obecności towarzyszącego pliku .mdf (definicja molekularna), który zawiera topologię, łączność wiązań i typy atomów.
Pliki .car są zwykle dystrybuowane jako dopasowany zestaw: archiwum współrzędnych (.car), plik topologii (.mdf) i plik pola siłowego (.frc) razem w pełni definiują model symulacyjny. Ten sam format jest również zapisywany z rozszerzeniem .arc. Własność przeszła z Biosym Technologies przez MSI (Molecular Simulations Inc.) i Accelrys do BIOVIA (Dassault Systèmes), która nadal odczytuje i zapisuje pliki .car za pośrednictwem Materials Studio. Konwertery open-source, takie jak Open Babel i Avogadro, obsługują ten format w systemach Windows, Linux i macOS.
Bezpieczeństwo
RYZYKO: LOWPlik Biosym CAR to nieszkodliwe dane współrzędnych w formacie tekstowym - nie zawiera treści wykonywalnych. Jedyną realną przestrogą jest pomyłka tożsamości: plik oznaczony jako .car może w rzeczywistości być modelem Assetto Corsa lub archiwum gry (binarnym), a nie danymi chemicznymi. Jeśli edytor tekstu pokazuje „!BIOSYM archive 3”, jest to format współrzędnych; jeśli pokazuje binarne „śmieci”, jest to jeden z innych typów .car.
Szczegóły formatu
w pigułce- Archiwum modelu samochodu Assetto Corsa (.car) - Pakiet danych/modelu pojazdu używany przez społeczność moderską symulatora wyścigowego Assetto Corsa; niepowiązany format binarny.
- Ogólne archiwum skompresowane (.car) - Różne stare archiwizatory/gry używały .car jako własnego skompresowanego kontenera (np. niektóre tytuły EA); brak jednego standardu.
- Plik aplikacji CazaSoftware / „Car Explorer” - Specyficzny dla aplikacji .car wymieniony w starszym wpisie bazy danych „Car Explorer”; niszowy i niebędący formatem współrzędnych chemicznych.
Programy otwierające pliki CAR
Windows4 apps
Avogadro
Open-source Bezpłatny edytor/wizualizator molekularny; otwórz .car, aby zobaczyć atomy w 3D (przez silnik Open Babel). 
Open Babel
Open-source Odczytaj/konwertuj CAR za pomocą „obabel input.car -O output.pdb”; wersja z GUI również go otwiera. 
BIOVIA Materials Studio
Płatny Zaimportuj .car (wraz z .mdf) do środowiska modelowania, aby przeglądać/edytować strukturę. 
macOS1 app
Open Babel / Avogadro
Open-source Zainstaluj przez Homebrew; konwertuj lub przeglądaj plik współrzędnych CAR. 
Linux2 apps
Open Babel
Open-source Odczytaj/konwertuj CAR za pomocą „obabel input.car -O output.pdb”; wersja z GUI również go otwiera. Szczegóły techniczne
specyfikacja| Klasa pliku | Tekstowe archiwum molekularnych współrzędnych kartezjańskich (modelowanie chemiczne) |
| Typ MIME | chemical/x-msi-car |
| Sygnatura nagłówka | Tekst ASCII „!BIOSYM archive 3” na offsecie bajtowym 0; brak binarnych magic bytes |
| Flaga periodycznych warunków brzegowych | Druga linia nagłówka: PBC=ON (periodyczny kryształ/polimer) lub PBC=OFF (izolowana cząsteczka) |
| Rekord komórki elementarnej | Obecny tylko gdy PBC=ON; określa długości sieci a, b, c oraz kąty α, β, γ |
| Pola rekordu atomu | Nazwa atomu, współrzędne kartezjańskie x/y/z (Å), nazwa reszty, symbol pierwiastka, ładunek cząstkowy |
| Pliki towarzyszące | .mdf (topologia i łączność) oraz .frc (parametry pola siłowego); sam .car jest niewystarczający do pełnego zdefiniowania modelu |
| Alternatywne rozszerzenie | .arc - identyczny format; zarówno .car, jak i .arc są generowane przez Insight II i Materials Studio |
| Kodowanie | 7-bitowy tekst jawny ASCII; brak sekcji binarnych lub zależności od kolejności bajtów |
| Kompresja | Brak wbudowanej; pliki są powszechnie dystrybuowane skompresowane gzipem (.car.gz) ze względu na powtarzalny tekst |
| Typowy rozmiar pliku | Od 1 KB do kilku MB, skaluje się liniowo wraz z liczbą atomów |
| Token wersji formatu | „archive 3” osadzony w nagłówku otwierającym; ta rewizja jest stabilna od początku lat 90. |
| Pochodzenie dewelopera | Biosym Technologies → MSI (Molecular Simulations Inc.) → Accelrys → BIOVIA (Dassault Systèmes) |
| Obsługa platform | Windows, Linux, macOS - wszędzie tam, gdzie zainstalowano BIOVIA Materials Studio, Open Babel, Avogadro lub VMD |
| Wydano | Late 1980s-1990s (Biosym Insight II / Discover molecular modelling) |
| Najnowsza wersja | Stable legacy format; still read/written by BIOVIA Materials Studio and Open Babel |
| Specyfikacja | openbabel.org |
Konwersje CAR
Pytania i odpowiedzi społeczności
pytania użytkownikówBrak pytań - bądź pierwszą osobą, która zapyta o pliki CAR.
