Hva er CAR-filformatet?
En .car-fil er en kartesisk koordinatfil i ren tekst som brukes i molekylær modellering. Hver fil lagrer informasjon om atomposisjoner - atomnavn, x/y/z-koordinater, elementsymboler, restidentifikatorer (residue identifiers) og delvise ladninger - én oppføring per atom.
.car-filer oppsto med Biosym Insight II og Discover-pakken på slutten av 1980-tallet og bruker et fullstendig menneskelig lesbart ASCII-format. En .car-fil åpnes med overskriftslinjen !BIOSYM archive 3, etterfulgt av et PBC=ON- eller PBC=OFF-flagg; når periodiske grensebetingelser er aktive, følger en enhetscelle-oppføring som lister opp celledimensjoner og vinkler umiddelbart etterpå. Det finnes ingen binære «magic bytes» - identifikasjon avhenger av den overskriften og tilstedeværelsen av en medfølgende .mdf-fil (molekylær definisjon), som inneholder topologi, bindingsforbindelser og atomtyper.
.car-filer distribueres normalt som et sett: koordinatarkivet (.car), en topologifil (.mdf) og en kraftfeltfil (.frc) definerer sammen en simuleringsmodell fullstendig. Det samme formatet skrives også med filendelsen .arc. Eierskapet gikk fra Biosym Technologies via MSI (Molecular Simulations Inc.) og Accelrys til BIOVIA (Dassault Systèmes), som fremdeles leser og skriver .car-filer via Materials Studio. Åpen kildekode-konvertere som Open Babel og Avogadro støtter formatet på tvers av Windows, Linux og macOS.
Sikkerhet og trygghet
RISIKO: LOWEn Biosym CAR-fil er ufarlige koordinatdata i ren tekst - ingen eksekverbart innhold. Den eneste reelle faren er identitetsforveksling: en fil merket .car kan faktisk være en Assetto Corsa-modell eller et spillarkiv (binært), ikke kjemidata. Hvis et tekstredigeringsprogram viser «!BIOSYM archive 3», er det koordinatformatet; hvis det viser binært søppel, er det en av de andre .car-typene.
Formatdetaljer
i et nøtteskall- Assetto Corsa bilmodell-arkiv (.car) - Kjøretøydata/modellpakke brukt av Assetto Corsa racing-sim modding-miljøet; urelatert binærformat.
- Generisk pakket arkiv (.car) - Ulike gamle arkiveringsprogrammer/spill brukte .car som en spesialtilpasset komprimert beholder (f.eks. enkelte EA-titler); ingen felles standard.
- CazaSoftware / «Car Explorer» app-fil - App-spesifikk .car referert til av den eldre databaseoppføringen «Car Explorer»; obskur og ikke kjemisk koordinatformat.
Programmer som åpner CAR-filer
Windows4 apps
Avogadro
Åpen kildekode Gratis molekylredigerer/visualiserer; åpne .car-filen for å se atomer i 3D (via Open Babel-motoren). 
Open Babel
Åpen kildekode Les/konverter CAR-filen med «obabel input.car -O output.pdb»; GUI-versjonen åpner den også. 
BIOVIA Materials Studio
Betalt Importer .car-filen (sammen med .mdf-filen) i modelleringsmiljøet for å vise/redigere strukturen. 
macOS1 app
Open Babel / Avogadro
Åpen kildekode Installer via Homebrew; konverter eller vis CAR-koordinatfilen. 
Linux2 apps
Open Babel
Åpen kildekode Les/konverter CAR-filen med «obabel input.car -O output.pdb»; GUI-versjonen åpner den også. Tekniske detaljer
dyp spesifikasjon| Filklasse | Molekylært kartesisk koordinatarkiv i ren tekst (kjemisk modellering) |
| MIME-type | chemical/x-msi-car |
| Header-signatur | ASCII-tekst «!BIOSYM archive 3» ved byte-offset 0; ingen binære magic bytes |
| Flagg for periodisk grense | Andre overskriftslinje: PBC=ON (periodisk krystall/polymer) eller PBC=OFF (isolert molekyl) |
| Enhetscelle-oppføring | Tilstede kun når PBC=ON; spesifiserer a, b, c gitterlengder og α, β, γ vinkler |
| Atom-oppføringsfelt | Atomnavn, x/y/z kartesiske koordinater (Å), restnavn, elementsymbol, delvis ladning |
| Ledsagerfiler | .mdf (topologi og konnektivitet) og .frc (kraftfeltparametre); .car alene er utilstrekkelig for å definere en modell fullstendig |
| Alternativ filendelse | .arc - identisk format; både .car og .arc produseres av Insight II og Materials Studio |
| Koding | 7-bit ASCII ren tekst; ingen binære seksjoner eller avhengighet av byte-rekkefølge |
| Komprimering | Ingen innebygd; filer distribueres ofte gzip-komprimert (.car.gz) på grunn av repeterende tekst |
| Typisk filstørrelse | 1 KB til noen få MB, skalerer lineært med antall atomer |
| Formatversjon-token | «archive 3» innebygd i åpningsoverskriften; denne revisjonen har vært stabil siden tidlig på 1990-tallet |
| Utviklerhistorikk | Biosym Technologies → MSI (Molecular Simulations Inc.) → Accelrys → BIOVIA (Dassault Systèmes) |
| Plattformstøtte | Windows, Linux, macOS - der BIOVIA Materials Studio, Open Babel, Avogadro eller VMD er installert |
| Utgitt | Late 1980s-1990s (Biosym Insight II / Discover molecular modelling) |
| Siste versjon | Stable legacy format; still read/written by BIOVIA Materials Studio and Open Babel |
| Spesifikasjon | openbabel.org |
CAR-konverteringer
Spørsmål og svar fra fellesskapet
spurt av brukereIngen spørsmål ennå - vær den første til å spørre om CAR-filer.
