Wat is het CAR-bestandsformaat?
Een .car-bestand is een Cartesiaans coördinatenbestand in platte tekst dat wordt gebruikt bij moleculaire modellering. Elk bestand slaat informatie op over atoomposities - atoomnamen, x/y/z-coördinaten, elementsymbolen, residu-identificatoren en partiële ladingen - één record per atoom.
.car-bestanden zijn eind jaren 80 ontstaan bij de Biosym Insight II- en Discover-suite en maken gebruik van een volledig menselijk leesbaar ASCII-formaat. Een .car-bestand opent met de headerregel !BIOSYM archive 3, gevolgd door een PBC=ON of PBC=OFF vlag; wanneer periodieke randvoorwaarden actief zijn, volgt onmiddellijk een eenheidscelrecord met celafmetingen en hoeken. Er zijn geen binaire magic bytes - identificatie is afhankelijk van die header en de aanwezigheid van een bijbehorend .mdf-bestand (moleculaire definitie), dat de topologie, verbindingsstructuur en atoomtypen bevat.
.car-bestanden worden normaal gesproken gedistribueerd als een bij elkaar passende set: het coördinatenarchief (.car), een topologiebestand (.mdf) en een krachtveldbestand (.frc) definiëren samen volledig een simulatiemodel. Hetzelfde formaat wordt ook geschreven met de .arc-extensie. Het eigendom ging over van Biosym Technologies via MSI (Molecular Simulations Inc.) en Accelrys naar BIOVIA (Dassault Systèmes), dat nog steeds .car-bestanden leest en schrijft via Materials Studio. Open-source converters zoals Open Babel en Avogadro ondersteunen het formaat op Windows, Linux en macOS.
Beveiliging & veiligheid
RISICO: LOWEen Biosym CAR-bestand is onschadelijke coördinatengegevens in platte tekst - geen uitvoerbare inhoud. De enige waarschuwing in de praktijk is identiteitsverwarring: een bestand met het label .car kan in werkelijkheid een Assetto Corsa-model of een game-archief (binair) zijn, geen chemiegegevens. Als een teksteditor „!BIOSYM archive 3” toont, is het het coördinatenformaat; als het binaire rommel toont, is het een van de andere .car-typen.
Formaatdetails
in een notendop- Assetto Corsa automodel-archief (.car) - Voertuiggegevens/modelpakket gebruikt door de Assetto Corsa racing-sim modding-gemeenschap; ongerelateerd binair formaat.
- Generiek verpakt archief (.car) - Verschillende oude archiveringsprogramma's/games gebruikten .car als een op maat gemaakte gecomprimeerde container (bijv. sommige EA-titels); geen enkele standaard.
- CazaSoftware / 'Car Explorer' app-bestand - App-specifieke .car waarnaar wordt verwezen door de verouderde DB-vermelding 'Car Explorer'; obscuur en niet het chemische coördinatenformaat.
Programma's die CAR-bestanden openen
Windows4 apps
Avogadro
Open-source Gratis moleculaire editor/visualizer; open de .car om atomen in 3D te bekijken (via Open Babel-backend). 
Open Babel
Open-source Lees/converteer de CAR met „obabel input.car -O output.pdb”; de GUI-versie opent het ook. 
BIOVIA Materials Studio
Betaald Importeer de .car (met de bijbehorende .mdf) in de modelleringsomgeving om de structuur te bekijken of te bewerken. 
macOS1 app
Open Babel / Avogadro
Open-source Installeer via Homebrew; converteer of bekijk het CAR-coördinatenbestand. 
Linux2 apps
Open Babel
Open-source Lees/converteer de CAR met „obabel input.car -O output.pdb”; de GUI-versie opent het ook. Technische details
diepe specificaties| Bestandsklasse | Platte tekst moleculair Cartesiaans coördinatenarchief (chemische modellering) |
| MIME-type | chemical/x-msi-car |
| Header-handtekening | ASCII-tekst „!BIOSYM archive 3” op byte-offset 0; geen binaire magic bytes |
| Periodieke randvlag | Tweede headerregel: PBC=ON (periodiek kristal/polymeer) of PBC=OFF (geïsoleerd molecuul) |
| Eenheidscelrecord | Alleen aanwezig wanneer PBC=ON; specificeert a, b, c roosterlengtes en α, β, γ hoeken |
| Atoomrecordvelden | Atoomnaam, x/y/z Cartesiaanse coördinaten (Å), residunaam, elementsymbool, partiële lading |
| Bijbehorende bestanden | .mdf (topologie en connectiviteit) en .frc (krachtveldparameters); .car alleen is onvoldoende om een model volledig te definiëren |
| Alternatieve extensie | .arc - identiek formaat; zowel .car als .arc worden geproduceerd door Insight II en Materials Studio |
| Codering | 7-bit ASCII platte tekst; geen binaire secties of afhankelijkheid van byte-volgorde |
| Compressie | Geen ingebouwde; bestanden worden vaak gzip-gecomprimeerd (.car.gz) gedistribueerd vanwege herhalende tekst |
| Typische bestandsgrootte | 1 KB tot enkele MB, lineair schaalbaar met het aantal atomen |
| Formaatversie-token | „archive 3” ingebed in de openingsheader; deze revisie is stabiel sinds het begin van de jaren 90 |
| Ontwikkelaarsgeschiedenis | Biosym Technologies → MSI (Molecular Simulations Inc.) → Accelrys → BIOVIA (Dassault Systèmes) |
| Platformondersteuning | Windows, Linux, macOS - overal waar BIOVIA Materials Studio, Open Babel, Avogadro of VMD zijn geïnstalleerd |
| Uitgebracht | Late 1980s-1990s (Biosym Insight II / Discover molecular modelling) |
| Laatste versie | Stable legacy format; still read/written by BIOVIA Materials Studio and Open Babel |
| Specificatie | openbabel.org |
CAR conversies
Community V&A
gevraagd door gebruikersNog geen vragen - wees de eerste om iets te vragen over CAR-bestanden.
