Vad är filformatet SVS?
.svs-filer är Aperio ScanScope Virtual Slide-bilder - stora helbildsbilder med flera upplösningar producerade av Aperio (numera Leica Biosystems) digitala patologiskannrar. Formatet bygger på TIFF-containern, utökad som en pyramid med flera kataloger: filen lagrar den skannade vävnaden i full upplösning tillsammans med progressivt nedskalade nivåer, vilket möjliggör effektiv panorering och zoomning vid valfri förstoring utan att hela gigapixelbilden behöver läsas in i minnet samtidigt.
En typisk .svs-fil från en 40x helbildsskanning varierar från 500 MB till över 5 GB. Lagret med full upplösning lagras som JPEG-komprimerade rutor (cirka 240×240 pixlar), följt av pyramid-nedskalningar, en miniatyrbild, en etikettbild (fotografi av den fysiska objektglas-etiketten) och en makrobild. Metadata - skannermodell, förstoring, mikron-per-pixel (MPP), färgningstyp och skanningsdatum - är inbäddad i TIFF-taggen ImageDescription som en huvudsträng för Aperio Image Library.
Formatet är proprietärt och formellt odokumenterat av Leica Biosystems, men OpenSlide-biblioteket erbjuder öppen källkod för läsåtkomst i Windows, Linux och macOS. .svs-filer används i stor utsträckning inom beräkningspatologi och AI/ML-cancerforskning. Kliniska implementeringar föredrar alltmer DICOM WSI (Supplement 145) eller OME-TIFF som öppna, interoperabla alternativ.
Säkerhet & trygghet
RISK: LOWBilddatafiler; inte körbara. Mycket stora filstorlekar kan orsaka problem med system som inte är utformade för gigapixelbilder. Inga kända skadliga koder för SVS-formatet.
Formatdetaljer
i ett nötskal- Microsoft Word Style Sheet Autosave - Äldre Word för DOS/Windows 3.x använde .svs för temporära filer vid automatisk sparande av stilmallar; helt orelaterat och föråldrat.
Program som öppnar SVS-filer
Windows3 apps
QuPath
Öppen källkod File → Open → välj .svs-fil. QuPath använder OpenSlide för läsning och tillhandahåller verktyg för annotering, mätning och AI-analys.
Aperio ImageScope
Gratis File → Open Slide → välj .svs-fil. Leicas officiella visningsprogram med fullständig metadatavisning och stöd för annoteringar.
3DHISTECH CaseViewer
Gratis Öppna SVS-filer via File → Open; stöder WSI i flera format inklusive SVS. 
macOS1 app
QuPath
Öppen källkod File → Open → välj .svs-fil. QuPath använder OpenSlide för läsning och tillhandahåller verktyg för annotering, mätning och AI-analys. 
Linux1 app
QuPath
Öppen källkod File → Open → välj .svs-fil. QuPath använder OpenSlide för läsning och tillhandahåller verktyg för annotering, mätning och AI-analys.
OMERO (institutional server)
Öppen källkod Ladda upp SVS till en OMERO-server; visa i webbläsaren via OMERO.web. Kräver institutionell implementering. Tekniska detaljer
djup specifikation| Utvecklare | Aperio Technologies (förvärvat av Leica Biosystems, 2012) |
| Bas-container | BigTIFF / TIFF-pyramid med flera kataloger |
| Magic bytes | II*\0 (49 49 2A 00) - little-endian TIFF; SVS identifieras av ImageDescription-taggen som innehåller «Aperio Image Library» |
| Byteordning | Little-endian |
| Komprimering | JPEG (rutor i full upplösning och pyramidnivåer); LZW eller okomprimerat (etikett- och makrobilder) |
| Rutstorlek | Vanligtvis 240×240 pixlar vid full upplösning |
| Färgdjup | 24 bpp RGB (H&E-histologi); 8 bpp gråskala (fluorescensavbildning) |
| Typisk filstorlek | 500 MB - 5 GB per 40x helbildsskanning |
| Maximala bilddimensioner | Upp till cirka 200 000×100 000 pixlar (40x helbild) |
| Metadataplats | TIFF ImageDescription-tagg: Aperio Image Library-version, skannermodell, förstoring, MPP, färgning, skanningsdatum |
| Läsare med öppen källkod | OpenSlide-biblioteket (plattformsoberoende, reverse-engineered; endast läsning) |
| Primärt användningsområde | Digital patologi, beräkningspatologi, AI/ML-cancerforskning |
| Pyramidstruktur | Full upplösning + mellanliggande nedskalningar + miniatyrbild (~1024×768) + etikettbild + makrobild |
| Öppna standardalternativ | DICOM WSI (Supplement 145) för klinisk användning; OME-TIFF för interoperabilitet inom forskning |
| Släppt | Early 2000s (Aperio ScanScope scanners) |
| Senaste version | Aperio SVS v2 (internal versioning; no public version history) |
| Specifikation | openslide.org |
SVS-konverteringar
Frågor & svar
frågat av användareInga frågor än - bli den första att fråga om SVS-filer.
