Che cos'è il formato di file SVS?
I file .svs sono immagini Aperio ScanScope Virtual Slide - immagini a vetrino intero ad alta risoluzione prodotte dagli scanner di patologia digitale Aperio (ora Leica Biosystems). Il formato è basato sullo standard del contenitore TIFF, esteso come una piramide multi-directory: il file memorizza il tessuto scansionato alla massima risoluzione insieme a livelli progressivamente sottocampionati, consentendo panoramiche e zoom efficienti a qualsiasi ingrandimento senza caricare l'intera immagine gigapixel in memoria contemporaneamente.
Un tipico file .svs derivante da una scansione a 40x varia da 500 MB a oltre 5 GB. Il livello a piena risoluzione è memorizzato come tasselli (tiles) compressi in JPEG (circa 240×240 pixel), seguiti dai sottocampionamenti piramidali, una miniatura, un'immagine dell'etichetta (fotografia dell'etichetta fisica del vetrino) e un'immagine macro. I metadati - modello dello scanner, ingrandimento, micron-per-pixel (MPP), tipo di colorazione e data di scansione - sono incorporati nel tag TIFF ImageDescription come stringa di intestazione «Aperio Image Library».
Il formato è proprietario e non formalmente documentato da Leica Biosystems, ma la libreria OpenSlide fornisce l'accesso in lettura open-source su Windows, Linux e macOS. I file .svs sono ampiamente utilizzati nella patologia computazionale e nella ricerca sul cancro tramite AI/ML. Le implementazioni cliniche preferiscono sempre più DICOM WSI (Supplement 145) o OME-TIFF come alternative aperte e interoperabili.
Sicurezza e incolumità
RISCHIO: LOWFile di dati immagine; non eseguibili. Le dimensioni molto elevate dei file possono causare problemi con sistemi non progettati per immagini gigapixel. Nessun vettore malware noto per il formato SVS.
Dettagli del formato
in sintesi- Microsoft Word Style Sheet Autosave - Le versioni legacy di Word per DOS/Windows 3.x utilizzavano .svs per i file temporanei di salvataggio automatico dei fogli di stile; del tutto non correlato e obsoleto.
Programmi che aprono file SVS
Windows3 apps
QuPath
Open-source File → Open → seleziona il file .svs. QuPath utilizza OpenSlide per la lettura e fornisce strumenti di annotazione, misurazione e analisi AI.
Aperio ImageScope
Gratuito File → Open Slide → seleziona il file .svs. Il visualizzatore ufficiale di Leica con visualizzazione completa dei metadati e supporto per le annotazioni.
3DHISTECH CaseViewer
Gratuito Apri i file SVS tramite File → Open; supporta WSI multi-formato incluso SVS. 
macOS1 app
QuPath
Open-source File → Open → seleziona il file .svs. QuPath utilizza OpenSlide per la lettura e fornisce strumenti di annotazione, misurazione e analisi AI. 
Linux1 app
QuPath
Open-source File → Open → seleziona il file .svs. QuPath utilizza OpenSlide per la lettura e fornisce strumenti di annotazione, misurazione e analisi AI.
OMERO (institutional server)
Open-source Carica i file SVS su un server OMERO; visualizzali nel browser tramite OMERO.web. Richiede un'implementazione istituzionale. Dettagli tecnici
specifiche approfondite| Sviluppatore | Aperio Technologies (acquisita da Leica Biosystems nel 2012) |
| Contenitore di base | BigTIFF / piramide TIFF multi-directory |
| Magic bytes | II*\0 (49 49 2A 00) - TIFF little-endian; SVS identificato dal tag ImageDescription contenente «Aperio Image Library» |
| Ordine dei byte | Little-endian |
| Compressione | JPEG (livelli piramidali e piena risoluzione a tasselli); LZW o non compresso (immagini etichetta e macro) |
| Dimensione tassello | In genere 240×240 pixel alla massima risoluzione |
| Profondità colore | 24 bpp RGB (istologia H&E); 8 bpp scala di grigi (imaging a fluorescenza) |
| Dimensione tipica del file | 500 MB - 5 GB per scansione a 40x |
| Dimensioni massime immagine | Fino a circa 200.000×100.000 pixel (vetrino intero 40x) |
| Posizione metadati | Tag TIFF ImageDescription: versione Aperio Image Library, modello scanner, ingrandimento, MPP, colorazione, data scansione |
| Lettore open-source | Libreria OpenSlide (multipiattaforma, tramite reverse-engineering; sola lettura) |
| Dominio d'uso primario | Patologia digitale, patologia computazionale, ricerca sul cancro AI/ML |
| Struttura piramidale | Risoluzione massima + sottocampionamenti intermedi + miniatura (~1024×768) + immagine etichetta + immagine macro |
| Alternative standard aperte | DICOM WSI (Supplement 145) per uso clinico; OME-TIFF per l'interoperabilità nella ricerca |
| Rilasciato | Early 2000s (Aperio ScanScope scanners) |
| Ultima versione | Aperio SVS v2 (internal versioning; no public version history) |
| Specifica | openslide.org |
Conversioni SVS
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