.SVS

SVS ファイル

Aperio ScanScope Virtual Slide
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SVS ファイルは、Leica Aperio ScanScope 顕微鏡スキャナーによって作成されるデジタル病理学のホールスライド画像です。これらのファイルは 1 つあたり 500 MB から 5 GB に及び、20 倍または 40 倍の倍率でギガピクセルの組織画像を保存します。QuPath(無料、クロスプラットフォーム)または Aperio ImageScope(無料、Windows)で開くことができます。標準的な画像エディタでは、このファイルサイズを処理できません。

開発元: Aperio Technologies (acquired by Leica Biosystems, 2012) カテゴリ: 画像ファイル MIME: image/tiff
対応OS Windows macOS Linux Web
関連: .ICO · .CUR · .CZI · .CSD

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19k+ 個の拡張子を索引済み
最終確認日:Jul 2, 2026

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SVS ファイル形式とは?

.svs ファイルは Aperio ScanScope 仮想スライド画像であり、Aperio(現 Leica Biosystems)のデジタル病理スキャナーによって生成される大規模な多重解像度ホールスライド画像です。この形式は TIFF コンテナ標準に基づいて構築されており、多重ディレクトリピラミッドとして拡張されています。ファイルには、フル解像度のスキャン済み組織とともに、段階的にダウンサンプリングされたレベルが保存されており、ギガピクセル画像全体を一度にメモリに読み込むことなく、任意の倍率で効率的なパンとズームを可能にします。

40 倍のホールスライドスキャンによる一般的な .svs ファイルのサイズは、500 MB から 5 GB 以上に及びます。フル解像度レイヤーは JPEG 圧縮されたタイル(約 240×240 ピクセル)として保存され、その後にピラミッドダウンサンプリング、サムネイル、ラベル画像(物理的なスライドラベルの写真)、およびマクロ画像が続きます。スキャナーのモデル、倍率、ピクセルあたりのミクロン(MPP)、染色タイプ、スキャン日付などのメタデータは、TIFF の ImageDescription タグ内に «Aperio Image Library» ヘッダー文字列として埋め込まれています。

この形式はプロプライエタリであり、Leica Biosystems によって公式に文書化されていませんが、OpenSlide ライブラリが Windows、Linux、および macOS でのオープンソースの読み取りアクセスを提供しています。.svs ファイルは、計算病理学や AI/ML を用いたがん研究で広く使用されています。臨床展開においては、オープンで相互運用可能な代替手段として DICOM WSI (Supplement 145) や OME-TIFF がますます好まれています。

セキュリティと安全性

リスク: LOW

画像データファイルであり、実行可能ではありません。非常に大きなファイルサイズは、ギガピクセル画像用に設計されていないシステムで問題を引き起こす可能性があります。SVS 形式に既知のマルウェアベクターはありません。

形式の詳細

概要
正式名称Aperio ScanScope Virtual Slide別名 Aperio SVS, Whole Slide Image (WSI)
開発元Aperio Technologies (acquired by Leica Biosystems, 2012)登場時期 Early 2000s (Aperio ScanScope scanners)
カテゴリ画像ファイル
MIME タイプimage/tiff
タイプ多重解像度 TIFF ベース・ホールスライド画像(バイナリ)
この拡張子は以下でも使用されています…
  • Microsoft Word Style Sheet Autosave - レガシーな Word for DOS/Windows 3.x は、スタイルシートの自動保存一時ファイルに .svs を使用していましたが、これは全く無関係で廃止されています。
マジックバイト ・ ファイルシグネチャ
オフセット
00010203
16進数
49492A00
ASCII
II*·
標準的なリトルエンディアン TIFF ヘッダーです。«Aperio» メタデータ文字列を含む ImageDescription タグと多重ディレクトリピラミッド構造によって、一般的な TIFF と SVS を区別します。

SVS ファイルを開くプログラム

Windows3 apps
QuPath オープンソース File → Open → .svs ファイルを選択。QuPath は読み取りに OpenSlide を使用し、注釈、測定、および AI 解析ツールを提供します。
Aperio ImageScope 無料 File → Open Slide → .svs ファイルを選択。フルメタデータ表示と注釈サポートを備えた Leica 公式ビューアです。
3DHISTECH CaseViewer 無料 File → Open から SVS ファイルを開きます。SVS を含むマルチフォーマットの WSI をサポートしています。
macOS1 app
QuPath オープンソース File → Open → .svs ファイルを選択。QuPath は読み取りに OpenSlide を使用し、注釈、測定、および AI 解析ツールを提供します。
Linux1 app
QuPath オープンソース File → Open → .svs ファイルを選択。QuPath は読み取りに OpenSlide を使用し、注釈、測定、および AI 解析ツールを提供します。
Web1 app
OMERO (institutional server) オープンソース SVS を OMERO サーバーにアップロードし、OMERO.web を介してブラウザで表示します。機関への導入が必要です。

技術的詳細

詳細仕様
開発者Aperio Technologies (2012年に Leica Biosystems が買収)
ベースコンテナBigTIFF / 多重ディレクトリ TIFF ピラミッド
マジックバイトII*\0 (49 49 2A 00) - リトルエンディアン TIFF。'Aperio Image Library' を含む ImageDescription タグによって SVS と識別されます
バイト順序リトルエンディアン
圧縮JPEG(タイル状のフル解像度およびピラミッドレベル)、LZW または非圧縮(ラベルおよびマクロ画像)
タイルサイズ通常、フル解像度で 240×240 ピクセル
色深度24 bpp RGB(H&E 組織学)、8 bpp グレースケール(蛍光イメージング)
一般的なファイルサイズ40 倍のホールスライドスキャンあたり 500 MB - 5 GB
最大画像寸法最大で約 200,000×100,000 ピクセル(40 倍フルスライド)
メタデータの場所TIFF ImageDescription タグ:Aperio Image Library バージョン、スキャナーモデル、倍率、MPP、染色、スキャン日付
オープンソースリーダーOpenSlide ライブラリ(クロスプラットフォーム、リバースエンジニアリング済み、読み取り専用)
主な使用領域デジタル病理学、計算病理学、AI/ML がん研究
ピラミッド構造フル解像度 + 中間ダウンサンプリング + サムネイル (~1024×768) + ラベル画像 + マクロ画像
オープン標準の代替案臨床用の DICOM WSI (Supplement 145)、研究の相互運用性のための OME-TIFF
リリース日Early 2000s (Aperio ScanScope scanners)
最新バージョンAperio SVS v2 (internal versioning; no public version history)
仕様書openslide.org

SVS の変換

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よくある質問

SVS ファイルを開くプログラムは何ですか?
QuPath(無料、オープンソース、クロスプラットフォーム)が最適な選択肢です。Leica 独自の Aperio ImageScope(Windows 用、無料)も信頼性があります。Photoshop のような標準的な画像エディタでは、ギガピクセルサイズを処理できません。
SVS ファイルのサイズはどのくらいですか?
倍率(20 倍 vs 40 倍)や組織の面積によりますが、通常 1 スライドあたり 500 MB から 5 GB です。フル解像度の 40 倍スライドは 2〜3 GB になることがあります。
ImageJ/Fiji で SVS を開くことはできますか?
はい。Bio-Formats プラグイン(Fiji に含まれています)を使用してください。これは Aperio SVS TIFF リーダーを介して SVS を読み取り、ピラミッドレベルを表示します。
SVS を TIFF や JPEG に変換するにはどうすればよいですか?
QuPath(File → Export region as image)または OpenSlide の Python バインディングを使用してください。スライド全体のフル解像度エクスポートは非常に大きなファイルを作成するため、関心領域(ROI)のみをエクスポートすることを検討してください。
SVS と NDPI の違いは何ですか?
どちらもホールスライド画像形式です。SVS は Aperio/Leica の形式であり、NDPI は Hamamatsu の形式です。どちらも TIFF ベースですが、ピラミッド構造とメタデータが異なります。QuPath と OpenSlide は両方の読み取りに対応しています。

参考文献

1OpenSlide - Aperio format specificationopenslide.org
2Bio-Formats - Aperio SVS TIFF documentationbio-formats.readthedocs.io

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