SVS ファイル形式とは?
.svs ファイルは Aperio ScanScope 仮想スライド画像であり、Aperio(現 Leica Biosystems)のデジタル病理スキャナーによって生成される大規模な多重解像度ホールスライド画像です。この形式は TIFF コンテナ標準に基づいて構築されており、多重ディレクトリピラミッドとして拡張されています。ファイルには、フル解像度のスキャン済み組織とともに、段階的にダウンサンプリングされたレベルが保存されており、ギガピクセル画像全体を一度にメモリに読み込むことなく、任意の倍率で効率的なパンとズームを可能にします。
40 倍のホールスライドスキャンによる一般的な .svs ファイルのサイズは、500 MB から 5 GB 以上に及びます。フル解像度レイヤーは JPEG 圧縮されたタイル(約 240×240 ピクセル)として保存され、その後にピラミッドダウンサンプリング、サムネイル、ラベル画像(物理的なスライドラベルの写真)、およびマクロ画像が続きます。スキャナーのモデル、倍率、ピクセルあたりのミクロン(MPP)、染色タイプ、スキャン日付などのメタデータは、TIFF の ImageDescription タグ内に «Aperio Image Library» ヘッダー文字列として埋め込まれています。
この形式はプロプライエタリであり、Leica Biosystems によって公式に文書化されていませんが、OpenSlide ライブラリが Windows、Linux、および macOS でのオープンソースの読み取りアクセスを提供しています。.svs ファイルは、計算病理学や AI/ML を用いたがん研究で広く使用されています。臨床展開においては、オープンで相互運用可能な代替手段として DICOM WSI (Supplement 145) や OME-TIFF がますます好まれています。
セキュリティと安全性
リスク: LOW画像データファイルであり、実行可能ではありません。非常に大きなファイルサイズは、ギガピクセル画像用に設計されていないシステムで問題を引き起こす可能性があります。SVS 形式に既知のマルウェアベクターはありません。
形式の詳細
概要- Microsoft Word Style Sheet Autosave - レガシーな Word for DOS/Windows 3.x は、スタイルシートの自動保存一時ファイルに .svs を使用していましたが、これは全く無関係で廃止されています。
SVS ファイルを開くプログラム
技術的詳細
詳細仕様| 開発者 | Aperio Technologies (2012年に Leica Biosystems が買収) |
| ベースコンテナ | BigTIFF / 多重ディレクトリ TIFF ピラミッド |
| マジックバイト | II*\0 (49 49 2A 00) - リトルエンディアン TIFF。'Aperio Image Library' を含む ImageDescription タグによって SVS と識別されます |
| バイト順序 | リトルエンディアン |
| 圧縮 | JPEG(タイル状のフル解像度およびピラミッドレベル)、LZW または非圧縮(ラベルおよびマクロ画像) |
| タイルサイズ | 通常、フル解像度で 240×240 ピクセル |
| 色深度 | 24 bpp RGB(H&E 組織学)、8 bpp グレースケール(蛍光イメージング) |
| 一般的なファイルサイズ | 40 倍のホールスライドスキャンあたり 500 MB - 5 GB |
| 最大画像寸法 | 最大で約 200,000×100,000 ピクセル(40 倍フルスライド) |
| メタデータの場所 | TIFF ImageDescription タグ:Aperio Image Library バージョン、スキャナーモデル、倍率、MPP、染色、スキャン日付 |
| オープンソースリーダー | OpenSlide ライブラリ(クロスプラットフォーム、リバースエンジニアリング済み、読み取り専用) |
| 主な使用領域 | デジタル病理学、計算病理学、AI/ML がん研究 |
| ピラミッド構造 | フル解像度 + 中間ダウンサンプリング + サムネイル (~1024×768) + ラベル画像 + マクロ画像 |
| オープン標準の代替案 | 臨床用の DICOM WSI (Supplement 145)、研究の相互運用性のための OME-TIFF |
| リリース日 | Early 2000s (Aperio ScanScope scanners) |
| 最新バージョン | Aperio SVS v2 (internal versioning; no public version history) |
| 仕様書 | openslide.org |
SVS の変換
コミュニティ Q&A
ユーザーからの質問まだ質問はありません。SVS ファイルについて最初の質問をしてみましょう。