Qu'est-ce que le format de fichier SVS ?
Les fichiers .svs sont des images Aperio ScanScope Virtual Slide - de grandes images de lames entières multi-résolution produites par les scanners de pathologie numérique Aperio (désormais Leica Biosystems). Le format est construit sur le standard de conteneur TIFF, étendu sous forme de pyramide multi-répertoires : le fichier stocke le tissu numérisé en pleine résolution aux côtés de niveaux progressivement sous-échantillonnés, permettant un panoramique et un zoom efficaces à n'importe quel grossissement sans charger l'intégralité de l'image gigapixel en mémoire.
Un fichier .svs typique provenant d'un scan de lame entière à 40x varie de 500 Mo à plus de 5 Go. La couche de pleine résolution est stockée sous forme de tuiles compressées en JPEG (environ 240×240 pixels), suivies des sous-échantillonnages pyramidaux, d'une vignette, d'une image d'étiquette (photographie de l'étiquette physique de la lame) et d'une image macro. Les métadonnées - modèle de scanner, grossissement, microns par pixel (MPP), type de coloration et date de numérisation - sont intégrées dans la balise TIFF ImageDescription sous la forme d'une chaîne d'en-tête « Aperio Image Library ».
Le format est propriétaire et n'est pas officiellement documenté par Leica Biosystems, mais la bibliothèque OpenSlide fournit un accès en lecture open-source sur Windows, Linux et macOS. Les fichiers .svs sont largement utilisés en pathologie computationnelle et dans la recherche sur le cancer par IA/ML. Les déploiements cliniques préfèrent de plus en plus le DICOM WSI (Supplément 145) ou l'OME-TIFF comme alternatives ouvertes et interopérables.
Sécurité et sûreté
RISQUE : LOWFichiers de données d'image ; non exécutables. Les tailles de fichiers très importantes peuvent causer des problèmes avec les systèmes non conçus pour les images gigapixel. Aucun vecteur de malware connu pour le format SVS.
Détails du format
en bref- Microsoft Word Style Sheet Autosave - L'ancienne version de Word pour DOS/Windows 3.x utilisait .svs pour les fichiers temporaires de sauvegarde automatique des feuilles de style ; totalement non lié et obsolète.
Programmes qui ouvrent les fichiers SVS
Windows3 apps
QuPath
Open-source File → Open → sélectionner le fichier .svs. QuPath utilise OpenSlide pour la lecture et fournit des outils d'annotation, de mesure et d'analyse par IA.
Aperio ImageScope
Gratuit File → Open Slide → sélectionner le fichier .svs. Le visionneur officiel de Leica avec affichage complet des métadonnées et prise en charge des annotations.
3DHISTECH CaseViewer
Gratuit Ouvrez les fichiers SVS via File → Open ; prend en charge le WSI multi-format, y compris le SVS. 
macOS1 app
QuPath
Open-source File → Open → sélectionner le fichier .svs. QuPath utilise OpenSlide pour la lecture et fournit des outils d'annotation, de mesure et d'analyse par IA. 
Linux1 app
QuPath
Open-source File → Open → sélectionner le fichier .svs. QuPath utilise OpenSlide pour la lecture et fournit des outils d'annotation, de mesure et d'analyse par IA.
OMERO (institutional server)
Open-source Téléchargez le SVS sur un serveur OMERO ; visualisez-le dans le navigateur via OMERO.web. Nécessite un déploiement institutionnel. Détails techniques
spécifications approfondies| Développeur | Aperio Technologies (acquis par Leica Biosystems en 2012) |
| Conteneur de base | BigTIFF / pyramide TIFF multi-répertoires |
| Octets magiques | II*\0 (49 49 2A 00) - TIFF little-endian ; SVS identifié par la balise ImageDescription contenant « Aperio Image Library » |
| Ordre des octets | Little-endian |
| Compression | JPEG (pleine résolution tuilée et niveaux de pyramide) ; LZW ou non compressé (images d'étiquette et macro) |
| Taille des tuiles | Généralement 240×240 pixels en pleine résolution |
| Profondeur de couleur | 24 bpp RGB (histologie H&E) ; 8 bpp niveaux de gris (imagerie par fluorescence) |
| Taille de fichier typique | 500 Mo - 5 Go par scan de lame entière à 40x |
| Dimensions maximales de l'image | Jusqu'à environ 200 000×100 000 pixels (lame complète 40x) |
| Emplacement des métadonnées | Balise TIFF ImageDescription : version Aperio Image Library, modèle de scanner, grossissement, MPP, coloration, date de numérisation |
| Lecteur open-source | Bibliothèque OpenSlide (multiplateforme, rétro-ingénierie ; lecture seule) |
| Domaine d'utilisation principal | Pathologie numérique, pathologie computationnelle, recherche sur le cancer par IA/ML |
| Structure pyramidale | Pleine résolution + sous-échantillonnages intermédiaires + vignette (~1024×768) + image d'étiquette + image macro |
| Alternatives aux standards ouverts | DICOM WSI (Supplément 145) pour l'usage clinique ; OME-TIFF pour l'interopérabilité en recherche |
| Publié | Early 2000s (Aperio ScanScope scanners) |
| Dernière version | Aperio SVS v2 (internal versioning; no public version history) |
| Spécification | openslide.org |
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